Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms