Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNNM1Q9NRU3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms