Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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