Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms