Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms