Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L4AQ9HCS5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41L4AQ9HCS5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms