Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSPNQ9HAW4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSPNQ9HAW4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms