Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRDE2Q9H7Z3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms