Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BCAS3Q9H6U6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms