Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms