Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms