Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms