Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP1Q9C000 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms