Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms