Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAPERQ9BY12 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms