Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms