Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RETNLBQ9BQ08 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms