Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CRBNQ96SW2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms