Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms