Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms