Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2Q96Q42 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms