Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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