Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms