Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms