Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms