Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms