Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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