Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM54Q969K7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM54Q969K7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms