Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRQ92752 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRQ92752 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRQ92752 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRQ92752 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRQ92752 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRQ92752 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRQ92752 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRQ92752 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRQ92752 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRQ92752 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRQ92752 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRQ92752 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRQ92752 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRQ92752 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNRQ92752 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRQ92752 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRQ92752 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms