Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms