Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
FAT3Q8TDW7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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