Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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TMIEQ8NEW7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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TMIEQ8NEW7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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TMIEQ8NEW7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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TMIEQ8NEW7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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TMIEQ8NEW7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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TMIEQ8NEW7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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TMIEQ8NEW7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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TMIEQ8NEW7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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TMIEQ8NEW7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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TMIEQ8NEW7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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