Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C17orf47Q8NEP4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms