Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ZNF439Q8NDP4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ZNF439Q8NDP4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ZNF439Q8NDP4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ZNF439Q8NDP4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ZNF439Q8NDP4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ZNF439Q8NDP4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF439Q8NDP4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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