Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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