Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms