Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC103Q8IW40 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms