Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms