Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HECW1Q76N89 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms