Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms