Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms