Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RINT1Q6NUQ1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RINT1Q6NUQ1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RINT1Q6NUQ1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RINT1Q6NUQ1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RINT1Q6NUQ1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RINT1Q6NUQ1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RINT1Q6NUQ1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RINT1Q6NUQ1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RINT1Q6NUQ1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RINT1Q6NUQ1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RINT1Q6NUQ1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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