Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL2Q6F5E8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms