Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRNL1Q5VV63 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms