Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms