Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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