Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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