Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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