Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
ITSN1Q15811 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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