Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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